मध्यकालीन उत्तर भारत में सल्तनत और मुगल काल के दौरान स्थापत्य कला के क्षेत्र में अधिकांशतः मकबरों और किलों का निर्माण किया गया, जिनमें स्वदेशी परंपराओं तथा इंडो-इस्लामिक तत्वों—विशेषकर मेहराब, गुंबद और मीनारों—का एक उत्कृष्ट सामंजस्य देखने को मिलता है। विशेषकर सल्तनतकालीन स्थापत्य में धरणिक शैली (Trabeate) तथा धनुषाकार (चापाकार) शैली का वैज्ञानिक सम्मिश्रण देखा जाता है, जिसके प्रमुख उदाहरण दिल्ली में अवस्थित कुव्वत-उल-इस्लाम मस्जिद और अलाई दरवाजा हैं। जबकि मुगलकालीन स्थापत्य अफगान, ईरानी तथा राजपूत शैली का मिश्रित रूप प्रस्तुत करते हैं। इसके प्रमुख उदाहरणों में सीकरी में निर्मित जोधाबाई का महल, जामा मस्जिद, लाल किला आदि हैं। इनके अलावा इस काल में पश्चिमी भारत में, गुजरात और मालवा के सुल्तानों के अधीन विशिष्ट प्रांतीय शैलियों का विकास हुआ। गुजरात की वास्तुकला पर क्षेत्रीय मंदिर स्थापत्य का प्रबल प्रभाव बना रहा, जो अहमदाबाद की जामी मस्जिद के जटिल नक्काशीदार स्तंभों में स्पष्ट रूप से दिखता है। इसके विपरीत, मालवा की वास्तुकला स्थानीय पठारी भूगोल से प्रभावित थी, जिसने मांडू के जहाज महल की भांति विशाल संरचनाओं, रैखिक नियोजन और सुव्यवस्थित स्थानिक व्यवस्था पर बल दिया, जिसमें उत्कृष्ट जल प्रबंधन की तकनीकें भी शामिल थीं।
पूर्वी भारत, विशेषकर सल्तनत काल में बंगाल में पत्थर की अनुपलब्धता के कारण ईंट एवं टेराकोटा (पकी मिट्टी) की एक विशिष्ट शैली का विकास हुआ। यहां बांस की झोपड़ियों से प्रेरित झुकती हुई कार्निस या बांग्ला छत शैली प्रमुखता से उभरी, साथ ही दीवारों पर टेराकोटा के जटिल नक्काशीदार पैनल का व्यापक उपयोग किया गया, जिसने कालांतर में मुगल वास्तुकला को भी महत्वपूर्ण रूप से प्रभावित किया। दूसरी ओर, दक्कन क्षेत्र में स्थानीय गहरे बेसाल्ट पत्थर के उपयोग से एक सशक्त स्थापत्य शैली विकसित हुई। बीजापुर का गोल गुंबद जैसी भव्य संरचनाएं क्षेत्रीय सौंदर्यबोध के साथ-साथ उन्नत गुंबद कला के सफल समन्वय को प्रभावशाली ढंग से प्रदर्शित करती हैं, जो विश्व में अपनी तरह के सबसे बड़े मुक्त-खड़े गुंबदों में से एक है।
इसके साथ ही, दक्षिण भारत में बहमनी साम्राज्य के बहमनशाह द्वारा विशाल इमारतों का निर्माण करवाया गया, जिनमें गुलबर्गा में निर्मित जामी मस्जिद उल्लेखनीय है। एक विशाल गुंबद तथा नुकीले मेहराबों के प्रयोग से बनाई गई यह मस्जिद एक ढकी हुई मस्जिद है, जबकि विजयनगर वास्तुकला में हम्पी जैसी संरचनाओं में विस्तृत और नक्काशीदार मंडपों, अलंकृत स्तंभों और गगनचुंबी गोपुरमों का निर्माण किया गया है, में द्रविड़ शैली की भव्यता को एक नए सामाजिक-सांस्कृतिक उत्कर्ष तक पहुंचाया गया।
इस प्रकार, मध्यकालीन भारतीय स्थापत्य कला क्षेत्रीय अनुकूलन और सांस्कृतिक संश्लेषण द्वारा चिह्नित थी, जो भारतीय समाज की बहुलवादी एवं गतिशील प्रकृति को प्रतिबिंबित करती है।
